Durante el movimiento de Independencia, mediante el Decreto Constitucional para la Libertad de América Mexicana de 22 de octubre de 1814, sancionado en Apatzingán, Michoacán, se instituyó en su artículo 134 la Secretaría de Guerra.

Posteriormente, al triunfo de la Independencia, el Reglamento para el Gobierno Interior y Exterior de las Secretarías de Estado y del Despacho Universal, del 8 de noviembre de 1821, creó la Secretaría de Estado de Guerra y Marina.

El 19 de agosto de 1870 se funda otra empresa naviera nacional. Nace la Compañía na de Vapores, que empieza a operar sus buques "Limarí" y "Copiapó", "Bío Bío" y "Maipú", tanto en cabotaje como en viajes al exterior.

Ante los nuevos competidores que atendían parte de su tráfico, la Pacific Steam Navegation Company bajó drásticamente sus fletes, lo que casi llevó a la quiebra a ambas compañías nas. Paralelamente inició gestiones para tratar de fusionarse con la Compañía na de Vapores, su más fuerte competidora.

Establecieron un régimen centralista, con una nueva organización política en el país. La Cuarta Ley, artículo 28, relativo a la organización del Supremo Poder Ejecutivo, creó el Ministerio de Guerra y Marina, determinación jurídica que fue ratificada el 13 de junio de 1843, en las Bases de Organización Política de la República.

Con la Constitución Federal de los Estados Unidos Mexicanos de 1824, se instituyó un Gobierno Republicano, Representativo y Federal, compuesto por Estados Libres y Soberanos en cuanto a su régimen interior, separándose por primera vez, los Supremos Poderes Federales en Ejecutivo, a cargo del Presidente de la República y un Vicepresidente; el Legislativo, del Congreso General; y el Judicial, de la Suprema Corte de Justicia, subsistiendo la Secretaría de Estado de Guerra y Marina. Las Leyes Constitucionales del 29 de diciembre de 1836.

Restablecido el Federalismo en 1846, se restauró la vigencia de la Constitución de 1824 y el 22 de abril de 1953, se expidieron las Bases para la Administración de la República hasta la Promulgación de la Constitución, figurando en su artículo primero, el Ministerio de Guerra y Marina, ratificando esta disposición, en el articulo 86 del Estatuto Orgánico Provisional de la República, expedido el 25 de mayo de 1856.

La promulgación de la Constitución Política de la República de 1857, que restauró constitucionalmente el federalismo en el país, el Ministerio conservó su denominación y no fué hasta el 23 de febrero de 1861, que con el Decreto sobre la Distribución de los Ramos de la Administración Pública, cambió su denominación por el de Secretaría de Estado y del Despacho de Guerra y Marina, situación que se mantuvo hasta la promulgación del Decreto del 16 de abril de 1861, que la denominó Secretaría de Guerra y Marina, reiterando su existencia los Decretos del 12 de junio y 16 de diciembre del mismo año, 13 de mayo de 1891 y 3 de diciembre de 1913.

En 1859 se produjo una revolución encabezada por Pedro León Gallo en el norte, que tuvo ramificaciones en el centro y sur del país. Fue necesario movilizar tropas para restaurar el orden y el Gobierno debió comprar el vapor "Independencia" y arrendar el vapor "Antonio Varas", los que se encontraban disponibles en el país gracias a la política de fomento a la Marina Mercante de dos décadas atrás. De esta manera, controlando el dominio del mar y teniendo la capacidad de transportar tropas y sus abastecimientos, el Gobierno no pudo finalmente sofocar al movimiento revolucionario, que contaba con cuantiosos recursos económicos.

En 1813 se decidió rebajar los derechos aduaneros a las mercancías que arribaran en buques de bandera na, a los buques que sus tripulaciones estuvieran compuestas por dos tercios de nos, a los buques comprados en el exterior y los insumos para mantener su operación. Pero estos esfuerzos no dieron los resultados esperados, debido a que el factor de riesgo era muy grande para los financistas, por estar aún indemne la flota española del Pacífico. Por estas razones, el Gobierno del General O'Higgins debió comprar con muchos sacrificios y esfuerzos, los buques necesarios para la magna empresa de liberar al Perú y contratar tripulantes extranjeros, que no todas las veces cumplían con los deberes para los cuales habían sido enganchados.

Acontecimientos en el Norte de Africa, en las primeras décadas del presente siglo, reclaman la intervención de las unidades de la Infantería de Marina que se distinguen en numerosas acciones: Desembarco y ocupación de Tánger(1901), desembarco en Larache (1911), combates de Bu-Maiza, T`Zaletza, el Fondak, Kudia Rapta y el desfiladero de Afarmun... En 1925 tiene lugar el desembarco de Alhucemas, brillante accion de los ejércitosd nacionales en que un Batallón expedicionario del Cuerpo toma parte, en vanguardia de la columna del General Fernandez Perez.

Las necesidades de las guerras carlistas cantonales y ultramarinas dan a la Infantería de Marina un carácter de fuerza expedicionaria, casi permanente.

Pasado el conflicto, una década después, encontramos una Marina Mercante pujante, que activamente transportaba mercancías a California, lugar donde la fiebre del oro atraía a miles de personas de distintas nacionalidades y orígenes. Nuestra Marina Mercante contribuyó con muchos de sus ciento diecinueve buques a mantener a los mineros californianos provistos de los artículos necesarios para su subsistencia. Por otro lado, los astilleros Duprat y de don Martín Stevenson en Valparaíso y los siete existentes en Constitución bullían de actividad de construcción ó reparación de naves.

Las campañas de Cochinchina (1858), Méjico (1862), Santo Domingo (1804) Cuba y Filipinas (1898), Africa (1911) son escenarios de los Batallones Expedicionarios, alguno de los cuales llegó a pasar diez años en ultramar.

Cuando el General Bernardo O'Higgins Riquelme formó la Primera Escuadra Nacional lo ha hecho con buques mercantes armados en guerra para disputar el dominio del mar al Imperio español. La naciente escuadra tuvo tanto éxito en su primera campaña, que no sólo capturó la fragata "Reina María Isabel", sino que también a seis transportes.

Esas naves constituían el apoyo logístico requerido por las tropas españolas para reducir las ansias de independencia de los criollos.

España había impuesto desde el tiempo de la conquista, el monopolio del comercio marítimo a buques de esa nacionalidad. La Nación na, que se encontraba en formación , aún no contaba con una Marina Mercante propia que pudiera haber provisto los buques necesarios para ese propósito.

Durante la Guerra contra la Confederación Perú-boliviana sucedió lo mismo, pero con menor gravedad, ya que existían algunas compañías que operaban buques en cabotaje y en viajes a Asia y a la costa occidental del continente americano, gracias a exenciones tributarias promulgadas en 1834 para incentivar la Marina Mercante.

A pesar de lo anterior, el Gobierno nuevamente tuvo problemas para adquirir naves para poder llevar las expediciones del Almirante Manuel Blanco Encalada y del General Manuel Bulnes Prieto al Perú, porque muchas naves nacionales habían cambiado de bandera ante el temor de los navieros de una eventual pérdida. Sin embargo, muchas de éstas se encontraban disponibles en el país, debido a un nuevo tratamiento especial para la Marina Mercante promulgada en 1836, lo que ya constituyó una fundamental diferencia con respecto a los tiempos de O'Higgins.

La gran actividad naviera inicial se vio perjudicada por la gran deserción de los capitanes y tripulantes al llegar a San Francisco. Estos solían dejar abandonadas las naves sin que pudieran retornar a , lo cual mermó en un tercio la cantidad de la oferta de transporte de cabotaje.

El 6 de septiembre de 1838, Guillermo Wheelwright, quien posteriormente construyera el ferrocarril de Copiapó a Caldera, fundó con capitalistas ingleses una empresa naviera de esa nacionalidad en Liverpool, que unió Europa con la costa occidental de Sudamérica, creando así a la Pacific Steam Navegation Company (P.S.N.C.), la cual obtuvo del Gobierno de el monopolio de la navegación a vapor por sus costas hasta 1845, extendida posteriormente hasta 1850.

El 15 de octubre de 1840 recalaban a Valparaíso, sus primeros vapores de 700 toneladas, de casco de madera, de nombres "" y "Perú", los que constituyeron la base de un lucrativo negocio que al correr de los años, en 1870, contaba con treinta y cinco buques con un total de 65.762 toneladas gruesas.

Paralelamente, los inversionistas nacionales se interesaron por el negocio naviero y formaron en 1864 la Compañía Nacional de Vapores, cuyo buque más representativo era el "Paquete del Maule", que podía remontar el río de ese nombre, lo cual constituía una ventaja ante los buques extranjeros.

Sin embargo, las compañías nas prefieron fusionarse entre sí, lo que es aprobado por Decreto Supremo de 9 de octubre de 1872. Su nuevo nombre fue Compañía Sud Americana de Vapores

Esto trajo la reacción de la P.S.N.C. que con una numerosa flota operando paralelamente a la C.S.A.V., disminuyó sus fletes hasta límites increíbles para sacar a su adversario del mercado, lo que trajo como consecuencia la inminente quiebra de la naciente Compañía.

Este contrato, aparte de salvar a la C.S.A.V. de una quiebra, contribuyó enormemente a la victoria obtenida durante la Guerra del Pacífico, por cuanto las naves de la Compañía Sud Americana de Vapores constituyeron la columna vertebral de los convoyes que transportaron nuestras tropas a los puntos de desembarco, asegurando además la logística necesaria para sostener las campañas terrestres y las comunicaciones con la Patria. Durante los cinco años de guerra transportaron 146.195 personas, que incluían tropas y autoridades de gobierno. Sin la participación de esas naves, la victoria habría sido obtenida en plazos más largos, con muchas dificultades y sacrificios inútiles de vidas.

El Gobierno del Presidente Federico Errázuriz Zañartu tuvo una preclara visión de los acontecimientos que sucedían en los paises limítrofes e intuyendo que el país podría necesitar de los servicios de buques mercantes en caso de un conflicto bélico, acudió en ayuda de la C.S.A.V. Es así, que el 5 de mayo de 1874 se firma un contrato entre el Gobierno y la C.S.A.V. en el cual se establecía que el primero subvencionaría por 10 años al segundo en $ 100.000 anuales, pagaderos en trimestres vencidos, condicionado a cumplir un tráfico establecido entre puertos nos, rebajas a fletes fiscales y otras garantías, más la obligación de entregar las naves en arrendamiento al Gobierno en caso de un conflicto bélico, aceptando la designación de jefes navales cuando se considerara conveniente.

En ese conflicto la Compañía Explotadora de Lota y Coronel aportó tres buques, el famoso "Matías Cousiño", el vapor "Carlos Roberto" y el vapor " Luis Cousiño ", los que transportaron el carbón para los buques de guerra nos y además movilizaron a alrededor de 15.000 soldados hacia y desde las áreas de operaciones.

Pasada la guerra, en 1884 se firma un nuevo contrato entre el Gobierno y la C.S.A.V. en términos semejantes al anterior y con muchas ventajas económicas para el primero.

A través de esta página, la Armada desea resaltar la labor de la Marina Mercante, la cual con su importante contribución anónima colaboró en la obtención de la victoria de nuestras armas en el siglo pasado.

Los ejemplos anteriores, debieran invitar a reflexionar sobre la importancia que ha tenido la Marina Mercante en la historia de , la que ha permanecido oculta, mas no olvidada, porque se ha preferido destacar hechos más heroicos.

Fomentar el incremento de nuestra Marina Mercante, es una de las formas de dar seguridad al país, porque aparte de llevar nuestros productos de exportación a los últimos confines del mundo y traer de ultramar aquellas mercancías necesarias para la industria, comercio, agricultura y otras actividades, su participación es indispensable en el caso que nuevamente el país requiera de sus servicios.

En los inicios de la Guerra Civil de 1891, cuando el Congreso Nacional se levantó contra el Gobierno del Presidente José Manuel Balmaceda Fernández con la ayuda de la mayoría de la Armada, las fuerzas rebeldes se apoderaron de casi todos los buques de la C.S.A.V. con los cuales aseguraron la logística y movilidad de las tropas y elementos necesarios para combatir a las fuerzas balmacedistas. Teniendo así, el dominio del mar y la logística asegurada, pudieron tomar la iniciativa estratégica desembarcando en los puntos elegidos, asegurando con ello su victoria.